Оптимизация методики выделения ДНК из листьев фундука и оценка эффективности SSR-маркеров для характеристики генетического разнообразия CORYLUS AVELLANA L.

Коллекции фундука (Corylus avellana L.) из приграничных субтропических районов выращивания могут быть важным источником толерантной зародышевой плазмы для выведения высокоустойчивых генотипов, адаптированных к изменяющимся условиям среды. Однако для эффективного использования этих зародышевых плазм требуется информация об их генетическом фоне. Поэтому, для характеристики и идентификации ценных образцов необходимы эффективные маркерные системы и качественный ДНК-материал. В данном исследовании проводилась оптимизация методики выделения ДНК из листьев фундука и оценивалась эффективность микросателлитных маркеров SSR для последующего генотипирования. Для выделения ДНК использовали классический СТАВ-метод и его модификации, а также два коммерческих набора. По результатам анализа, вариант с добавлением в состав СТАВ-буфера 2%-ного РVР (m. w. 40 000) показал лучший выход ДНК для ПЦР-анализа. В результате оценки эффективности, четыре из 26 SSR-маркеров, а именно А604 (Na = 2,65, He = 0,62, Ho = 0,57), А611 (Na = 2,80, He = 0,64, Ho = 0,86), В606 (Na = 2,80, He = 0,64, Ho = 0,57) показали хорошую применимость для оценки генетического разнообразия C. avellana. Также авторами отмечена необходимость продолжить поиск и разработку более эффективных SSR-маркеров для оценки генетического разнообразия и филогенетических исследований фундука. Полученные результаты важны для сохранения и грамотного управления генетическими ресурсами фундука на территории Западного Кавказа и могут быть использованы для оптимизации будущих исследований путём определения минимального количества образцов, на которых следует сосредоточиться при повышении эффективности разведения.